环境保护税法设置了两档差别化减税优惠政策，2018年，上海市400余户环境保护税纳税企业享受了减免优惠。
“环境保护税立法后，我们认识到环境保护税税额的大小完全取决于排污量的多少，我们想要减少税负，就必须加大节能减排力度，改善产品生产工艺。”上海永茂泰汽车科技股份有限公司法定代表人徐先生表示。
该企业先后投入300余万元资金进行专项改造，在使用新设备、新工艺后，废气排放量降低近90%。2017年该企业缴纳排污费5万多元，2018年只需缴纳环境保护税近1万元。
同样受到减免措施影响的还有上海市固体废物处置有限公司，该公司是一家处理上海全市产生的医疗废物的企业，全年各排放口数据均受到市生态环境部门在线联网监测。
公司的财务负责人曾经计算过一笔账：“我们公司全年投入1900多万元的改造资金，从金额上说是多了一些，但是有一点很重要，现在的税费是根据排放污染物的量而不断变化的。”他表示，可以通过监控和计算税额，认清企业的现实技术情况，再通过工艺升级、生产转型、采用绿色原材料等措施来改进。2018年企业不仅减少污染物排放2000KG，获得20多万的税收减免，企业的转型升级和高质量发展也增强了综合竞争力。
复旦大学环境经济研究中心副主任李志青认为，污染防治是一项系统性工程，要占用大量社会经济资源，因此就需要引入和调动排放主体更强的环保意识和积极性。
“免征措施作为一种激励机制，也可以视为是一种成本上的补贴。”李志青表示，“‘多排多缴、少排少缴、不排不缴’，环境保护税的征收确实在一定程度上倒逼企业从清洁生产、集中处理及源头减排等方面加强污染防治。”
从单一监督管理到综合协调，环境保护税的征收模式经过了多部门的探索协调。
按照《中华人民共和国环境保护税法》及其实施条例有关要求，市财政、税务、环保部门就应税污染物适用问题、税收减免适用问题、应税污染物排放量的监测计算问题，积极进行征管协作配合。
据了解，上海市税务部门与上海市生态环境部门密切协作，建立了环境保护税涉税信息比对复核工作机制，在开展申报信息比对复核工作基础上，通过对典型企业的深入剖析、聚焦比对复核的重点内容，规范复核流程，明确复核责任，形成征管闭环，堵塞管理漏洞。
双方通过共同开发的“信息共享平台”，按季传输涉税信息和环保监测等信息，在信息交换的基础上进行涉税信息比对复核工作，建立“环保处罚—比对识别—税款追征”常态管理机制，对技术规范不达标企业排放量的计算方法和计税依据实行动态监控，通过政策再辅导，提高征管质效。
目前平台已传输40余万条环境保护税涉税数据、250余户企业的排污许可证信息，全年追缴税款170余万元，多方征管协作使环境保护税严格征收落到实处。
环境保护税的开征成为助推生态环境建设的一项重要内容，也实现了“费改税”的平稳过渡，正在促使企业不断朝着节能减排、绿色生产的方向发展。
2018年上海市PM2.5年均浓度达到36微克/立方米，同比下降7.7%。AQI优良率为81.1%，同比上升5.8个百分点，空气质量明显好转。
环境保护税实施一年以来，仍有面临不少“成长的烦恼”。
从征收对象上，现有环境保护税纳税人范围仅仅覆盖了全市主要固定的排放源。上海市生态环境部门相关负责人表示：“2019年将全面完成第二次污染源普查，2020年将基本完成覆盖所有固定污染源的排污许可证核发工作，同时强化与税务部门的信息共享，为税务部门开展税源识别提供支撑保障。”
从征收税目上，环境保护税覆盖范围仍可调整。以环境空气质量为例，以PM2.5和O3为特征污染物的复合污染形势依然严峻，但VOCs（挥发性有机物）作为其前体控制物，却并未纳入环境保护税征收范围。
“要进一步突出需求导向，建议适时考虑增加地方授权事项，为实施精准治污提供政策支持。”上海市环境科学院主任胡静建议，财税部门与生态环境部门联合开展相关研究，持续跟踪评估VOCs排放对本市环境空气质量的影响，加快完善VOCs排放总量的核算方法和监测技术，为后续进一步优化环境保护税制度体系奠定坚实基础。
从排放量申报上，费改税后，以监测数据进行计算的排放口占总排放口的85%以上。目前，监测数据质量参差不齐的现象仍然存在。
据悉，为提高本市生态环境监测数据质量，上海市委办公厅、市政府办公厅印发了《上海市深化环境监测改革提高环境监测数据质量实施方案》，上海市生态环境局出台《上海市生态环境监测质量监督检查三年行动计划（2018-2020年）》。
“制度是保证，落实是关键。”胡静建议，相关部门应进一步明确责任，健全制度，加强协作，从资质的认定和管理，标准的统一规范、质量的监督检查等角度全面推进，为污染物监测数据质量提供保障。
国家税务总局上海市税务局相关负责人表示，将进一步加强与生态环境部门的协作，充分利用专业部门复核工作的成果，深入挖掘数据间的关系，探索建立风险管理指标，筛选风险管理对象，强化后续管理，切实提高环境保护税征管质效，为“绿水青山”贡献税务力量。
