《整改方案》要求，以习近平新时代中国特色社会主义思想和党的十九大精神为指导，以习近平生态文明思想为根本遵循和行动指南，深入贯彻习近平总书记对广东重要讲话和重要指示批示精神，坚决落实党中央、国务院关于生态文明建设和生态环境保护的重大决策部署，切实把做好中央环境保护督察“回头看”整改作为牢固树立“四个意识”、坚定“四个自信”、坚决做到“两个维护”的政治要求和具体行动，逐项压实责任、全面溯源挖根，分类施策、系统推进，以断然之举动真碰硬，全力打好污染防治攻坚战和生态文明建设持久战，开创广东生态文明建设和生态环境保护工作新局面。
针对中央环境保护督察组反馈意见，《整改方案》梳理分解分列出中央环保督察“回头看”督察反馈意见整改措施清单（43项）和固体废物环境问题专项督察反馈意见整改措施清单（19项），逐项建立整改台账和任务清单，明确目标任务、责任分工和完成时限，将具体整改责任落实到省有关部门和各地级以上市党委、政府。《整改方案》要求，按照“问题导向、彻底整改，聚焦短板、系统治理，尊重规律、标本兼治，联防联治、共建共享”的基本原则，做到全面整改、彻底整改。抓住粤港澳大湾区建设重大历史机遇，深化粤港澳生态环保合作，加强同邻近省份开展污染联防联治协作，形成互助共济合力，打造区域生态文明建设合作典范。
《整改方案》明确了整改目标，确保2016年中央环境保护督察反馈问题及2018年“回头看”反馈问题整改项项有着落、件件有回音、事事见成效。聚力攻克制约广东生态文明建设的瓶颈，到2020年，基本补齐环保基础设施突出短板，补上生态环保欠账，总体改善生态环境质量，实现环境质量状况、绿色发展水平、生态环境治理能力走在全国前列。全省水环境质量实现明显好转，地表水国考断面优良水体比例达84.5%以上，重污染河流水质明显改善，消除劣Ⅴ类水体，基本消除地级以上市城市建成区黑臭水体；全省空气质量优良天数比例达到92.5%，PM2.5控制在33微克/立方米以下，基本消除重污染天气；土壤环境风险安全可控，受污染耕地安全利用率达到87%左右，污染地块安全利用率不低于90%；加快补上环保基础设施欠账，城市污水处理率达到95%以上；加快构建现代化环境治理体系，以粤港澳大湾区建设为引领，初步构建与“四个走在全国前列”、当好“两个重要窗口”目标要求相适应的生态环境管理治理体系。
《整改方案》制定了6大类23个方面的整改措施。一是提高政治站位，全面压实生态文明建设政治责任。切实增强践行习近平生态文明思想的政治自觉，把思想和行动统一到党中央决策部署上来。全面压实生态环境保护政治责任，强化生态环境保护考核激励，激励广大干部全力以赴抓好督察反馈问题整改，坚定有序打好污染防治攻坚战。二是强化生态绿色引领，着力推动高质量发展。坚持新发展理念，努力打造高质量发展的先行区示范区，从根本上解决环境污染问题。以“三线一单”为抓手，全面构建“一核一带一区”区域发展新格局。全面推进绿色发展，优化调整产业、能源、交通运输等结构。大力发展节能环保产业，推动节能环保产业做大做强。三是加快补上生态欠账，坚决打好污染防治攻坚战。突出抓好水污染治理，加强饮用水水源地环境保护，聚力国考断面达标攻坚，系统治理重点流域污染，完善城镇生活污水处理设施和配套管网。打好农业农村污染治理攻坚战，建立健全整县推进农村环境整治机制，强化畜禽养殖业污染防治，着力提升农村生活垃圾规范化处理水平，严格控制农业面源污染。持续打好蓝天保卫战，系统开展城市空气质量达标管理，协同控制PM2.5和臭氧浓度。扎实打好净土防御战，确保受污染耕地和污染地块安全利用，保障农产品质量及人居环境安全。统筹做好2016年第一轮中央环境保护督察整改和督察“回头看”整改工作。四是聚焦突出短板，加强固体废物全过程监管。加强固体废物源头防控管理，着力解决固体废物瞒报漏报、底数不清问题。加快补齐固体废物处理处置能力短板，将危险废物处置设施建设情况纳入环境保护责任考核，压实地方政府项目建设属地责任。建立健全责任明晰的全过程监管体系，严厉打击固体废物非法转移倾倒处置行为。五是深化区域联防联控，形成生态环境共建共治共享格局。全面实施《粤港澳大湾区发展规划纲要》，统筹规划大湾区水源布局，持续实施粤港珠三角空气质素管理计划，将粤港澳大湾区打造成为更具全球竞争力的生态湾区样板，成为宜居宜业宜游的优质生活圈。健全区域污染联防联治机制，务实推进泛珠三角区域生态环境保护合作，加强与相邻省（区）开展污染联防联治协作。推进生态环境保护社会共治，建立完善公众参与环境管理决策的有效渠道和合理机制。六是深化生态文明体制改革，健全生态环境保护长效机制。先行先试，深入推进生态环境保护领域改革创新，用最严格制度最严密法治保护生态环境。加快健全自然资源资产产权制度、资源有偿使用和生态补偿制度等8项制度建设。严格生态环境保护法治，健全环境信用评价制度和环境失信企业联合惩戒制度。健全市场激励约束机制，严格限制“两高一资”和过剩产能扩张类项目融资。提升生态环境保护监测监管能力，提高突发环境事件应急响应能力。增强生态环境保护科技支撑，构建大数据及“互联网+”智慧环保体系。
为保障整改工作顺利开展，《整改方案》明确了五个方面保障措施。一是加强组织领导。切实加强党对督察整改工作的领导，全面建立省市县三级联动机制。二是严格督导检查。加强日常调度和督促检查，对重点整改事项开展专项督导，确保整改工作落地见效。三是严肃责任追究。针对中央环保督察组移交的7个生态环境损害责任追究问题进行认真调查，依法依规严肃处理。四是加大环保投入。省市县各级财政统筹资金保障污染防治攻坚战三年行动计划各项任务落地，并优先用于环境保护督察“回头看”问题的整改，对于环境保护督察整改取得良好效果的，在环境保护财政资金分配上加大激励力度。五是强化信息公开。对整改不力、问题突出的地区和单位，加大曝光力度，充分发挥公众和新闻媒体等社会力量的监督作用。
