自2009年以来，通过公开竞争，济宁市11个县（市、区）全部成为全国小型农田水利重点县，实现小农水重点县建设全覆盖，重点解决农田灌排"最后一公里工程""卡脖子工程"。建设期规划总投资约17.85亿元，其中争取省以上投资12.07亿元，"十二五"期间规划治理面积203万亩。截至目前，共完成投资12.9亿元，其中省以上投资8.42亿元。
在井灌区，推广无井房IC卡控制管道灌溉技术，使原来靠天吃饭和有井无配套设施的"光杆"井灌区，变成了刷卡就能把灌溉水输送到每户农田的节水灌溉，彻底改变了原来全家人自带机泵、车推人抬忙活几天浇地的状况，灌溉成本也从原来的每亩地30多元，降到现在的不到10元钱；在引湖、引黄、引河渠灌区，对泵站灌区进行了高标准重建或改建，对田间工程进行了全面配套，使标准低、配套差、老化失修、灌排无保障的农田变成了旱能浇、涝能排的节水灌溉高产田，充分利用了地表水，保护了地下水资源，而且节省了灌溉成本；在东部山区，大力建设小塘坝，小截浅，努力增加新水源，发展喷滴灌等高效节水灌溉工程，为农民的增产增收打下了坚实的基础，被当地老百姓称为"幸福水""致富水"。
通过5年的建设，新增、恢复灌溉面积39.1万亩，改善灌溉面积150.6万亩，建成了190万亩"田成方、路成网、沟相通、渠相连、旱能浇、涝能排、环境美化"的高标准农田。至2013年底，全市有效灌溉面积达到702.7万亩，占耕地面积的86.8%，节水灌溉面积达到337万亩，占有效灌溉面积的48%，农业灌溉水有效利用系数达到0.63。全市共建井灌区523.7万亩，配套机电井11.6万眼；建成引湖、引河灌区289.7万亩，排灌站1807处；建成大中小型水库313座（大型2座、中型3座、小型307座），塘坝1574座，水库塘坝灌区灌溉33.6万亩；建成陈垓、国那里两处大型引黄灌区，设计灌溉面积73.2万亩，中型灌区25处，设计灌溉面积92万亩，小型灌区1241处，灌溉面积225万亩。农业生产条件显著改善，农业抗御自然灾害能力明显提升，粮食生产的综合保障能力大大增强。同时，新技术、新材料的应用，改善了农民的生产条件，降低了劳动强度和灌排成本，减轻了农民负担，增加了农民收入。
为做好小农水工程的建后管护，2012年，济宁市在全省率先制定出台了《济宁市小型农田水利设施维护管理办法》，明确小型农田水利设施管理的直接责任人、具体实施者和维修管理费来源。按照《维护管理办法》的要求，市财政每年拿出1000万元专项资金，通过公开竞争立项的办法，用于小型农田水利设施维护管理，重点对县市区小型农田水利设施维护管理给与支持,使县域内农田灌溉"最后一公里"、"卡脖子"工程的建后管护得到根本改善。同时，进一步完善了水利基层服务体系，全市146个乡镇全部恢复和建立了水利站，加强水利服务热线116建设，使小型农田水利设施维护管理水平显著提升，确保农田水利工程平时有人管，坏了有人修，有钱修，有力保障了农田水利设施长期良性运转，长期发挥效益。
通过近几年的高强度持续建设，全市的农田水利设施日趋完善，管护能力和水平逐步提高，为抗御水旱灾害、改善农业生产条件、促进农业持续发展奠定了坚实基础，有力地支撑了济宁市粮食生产"十一连增"。
