根据2014 年《中国环境状况公报》：全国423 条主要河流、62 座重点湖泊(水库)的968 个国控地表水监测断面(点位)开展了水质监测，Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、劣Ⅴ类水质断面分别占3.4%、30.4%、29.3%、20.9%、6.8%、9.2%，主要污染指标为化学需氧量、总磷和五日生化需氧量。对比来看，北方地区污染程度较重，治理需求大。
另外，《中国环境状况公报》还显示，某些流域的干流、支流水质情况差异较大，尤其是支流方面，污染情况更为严重，如淮河干流水质全年都在Ⅳ类水以上，但主要支流的劣Ⅴ类水体超过23%;在各大水系中海河的劣Ⅴ类水质程度最高，国控断面监测数据表明，干流劣Ⅴ类达37%、支流劣Ⅴ类达44%。
所谓“黑臭”，主要属于环境景观、物理指标范畴，是指在视觉上河流水体呈现因污染而产生的明显异常颜色(通常是黑色或泛黑色)，同时产生在嗅觉上引起人们感觉不适甚至厌恶的气味，是水体感官性污染最常见的一种现象。
中国产业信息网发布的《2015-2020年中国污水处理行业运行态势及投资战略研究报告》指出：我国河流黑臭现象最早出现在上海苏州河，随后南京的秦淮河、苏州的外城河、武汉的黄孝河和宁波的内河等，均出现不同程度的黑臭现象。近几十年来，黑臭水体的范围和程度不断加剧，在全国大部分城市河段中，流经繁华区域的水体绝大部分受到不同程度的污染，尤其是各大流域的事级与三级支流的黑臭问题更加突出，且劣化程度逐年提高。
据统计，我国城镇仍有约20%的污水直排和溢流，这是造成河湖黑臭问题80%的主要症结，这20%的污水包括污水处理厂的溢流水、分散点源污水、管网待压溢流污水、雨污河流制面源污水等。我国的水污染控制和治理措施滞后于城市化和工业化迚程，导致城镇河流等水体直接成为工业、农业及生活废水的主要排放通道和场所，水体吸纳的污染量超过自身自净能力，造成大面积受污染，水体逐渐富营养化，形成黑臭水体，如此情景在部分中小城市中尤为普遍。
黑臭水体治理难点：死水活化难、底泥清理难、污染源截污难。
“由清变黑易，由差变好难”：对于生态功能碎片化的水体，水流沟通难度大，要使其流动起来需要耗费大量的人力、物力、财力，否则，即使经过截污、技术处理、底泥疏浚消除黑臭，水体在不流动的情况下，大气中污染物沉降也极易再次造成水体污染，管理不到位会很快反弹。
底泥疏浚工程浩大：长年累月的黑臭水体在河流底部积累了大量的淤泥，有些淤泥厚达1～2米，其中含有大量的污染物、有机物、无机物等，疏浚清淤工程浩大;大量的淤泥从河道挖出后无处存放，处于“不清污染，清则无处安放”的处置两难境地。
截污治污难：治污难点在于点多面广成分复杂，仸务重能力低下，污水收集治理能力不足，管网不配套，甚至很多大中城市污水收集系统不完善，如目前深圳还缺少5000 公里左右污水收集管网，城市每天有90 万吨污水未经处理直排入水环境。
